Wat om te weet
- 'n FNA-lêer is 'n FASTA-formaat DNA- en proteïenvolgordebelyningslêer.
- Maak een oop met Geneious.
- Skakel oor na FASTA en soortgelyke formate met daardie selfde program.
Hierdie artikel verduidelik wat 'n FNA-lêer is, hoe om een oop te maak en hoe om een in 'n ander formaat te stoor soos FASTA, GB, VCF, beelde, ens.
Wat is 'n FNA-lêer?
'n Lêer met die FNA-lêeruitbreiding is 'n FASTA-formaat DNA- en proteïenvolgordebelyningslêer wat DNA-inligting stoor wat deur molekulêre biologie sagteware gebruik kan word.
FNA-lêers kan spesifiek gebruik word om net nukleïensuurinligting te hou terwyl ander FASTA-formate ander DNS-verwante inligting bevat, soos dié met die FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET- of AA-lêeruitbreidings.
Hierdie teksgebaseerde FASTA-formate het oorspronklik ontstaan uit 'n sagtewarepakket met dieselfde naam, maar word nou as 'n standaard in DNS- en proteïenvolgordebelyningstoepassings gebruik.
FNA verwys ook na sommige tegnologieterme wat niks met hierdie lêerformaat te doen het nie, soos finale netwerkaanvaarding, lêernaam/kenmerkvergrotingsfasiliteit, Fujitsu-netwerkargitektuur en vinnige buuradvertensie.
Hoe om 'n FNA-lêer oop te maak
Maak een oop in Windows, macOS en Linux met Geneious (dit is gratis vir 14 dae). Om dit te doen, navigeer na die File > Import-kieslys en kies om die lêer in te voer via die From Filespyskaart-item.
Jy kan dalk ook een oopmaak met BLAST Ring Image Generator (BRIG).
Probeer Notepad++ of 'n ander teksredigeerder as daardie idees nie uitwerk nie. Die lêer kan inderdaad teksgebaseer en maklik wees om te lees, of jy kan vind dat dit niks met die FASTA-formaat te doen het nie, in welke geval die opening van die lêer as 'n teksdokument teks kan openbaar wat identifiseer wat gebruik is om die lêer te skep of in watter formaat die lêer is.
Hoe om 'n FNA-lêer om te skakel
Ons kan dit nie verifieer nie aangesien ons dit nie probeer het nie, maar jy behoort Geneious te kan gebruik om die lêer na baie ander formate om te skakel, soos FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV en VCF. Dit kan gedoen word deur die program se File > Uitvoer spyskaart.
Daardie selfde program behoort ook die lêer in PNG, JPG, EPS of PDF te kan stoor, via File > Save As Image File.
Alhoewel jy normaalweg nie net 'n lêer se uitbreiding na iets anders kan hernoem en verwag dat dit op dieselfde manier sal werk nie, kan jy 'n. FNA-lêer na 'n. FA-lêer hernoem as jou spesifieke DNA-volgorde-sagteware net sal herken die FA-formaat.
In plaas daarvan om lêeruitbreidings te hernoem, sal jy 'n gratis lêeromskakelaar wil gebruik om ander lêertipes om te skakel. In die geval met FNA- en FA-lêers, gebeur dit net so dat sommige programme slegs lêers sal oopmaak wat die FA-lêeruitbreiding het, in welke geval die hernoeming daarvan goed behoort te werk.
Kan dit steeds nie oopmaak nie?
As jy steeds nie jou lêer kan oopmaak nadat jy die programme van bo gebruik het nie, sal jy dalk vind dat die lêeruitbreiding nie eintlik. FNA lees nie, maar eerder iets wat net soortgelyk lyk.
Byvoorbeeld, FNG (Font Navigator Group)-lêers lyk baie soos hulle sê ". FNA", maar as jy mooi kyk, is net die eerste twee letters dieselfde. Aangesien die lêeruitbreidings verskillend is, is dit 'n aanduiding dat hulle van 'n ander lêerformaat is en heel waarskynlik nie met dieselfde programme sal werk nie.
Dieselfde kan gesê word vir baie ander lêeruitbreidings soos FAX, FAS (Saamgestelde Fast-Load AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue Functions) en FND (Windows Saved Search).
Die idee hier is om net seker te maak dat die lêeruitbreiding. FNA lees. As dit wel gebeur, probeer weer om die programme van bo af te gebruik om dit oop te maak of om te skakel. As jy 'n ander soort lêer het, ondersoek die uitbreiding daarvan om uit te vind watter toepassings nodig is om dit oop te maak of om te skakel.
Gereelde Vrae
Hoe maak jy 'n FNA-lêer in Python oop?
Eers, skakel die FNA-lêer na FASTA-formaat met 'n derdeparty-toepassing soos Geneious. Dan kan jy Biopython aflaai, 'n stel vrylik beskikbare instrumente vir biologiese berekening vir werk in bioinformatika. Laastens, verwys na die Biopython-tutoriaal en -kookboek vir instruksies oor hoe om met FASTA-lêers te werk.
Hoe vind ek my FNA-vervaardigernommers op 'n Ancestry-rou-lêer?
Jy kan die meeste DNA-data van Ancestry.com aflaai in.txt-formaat. Slegs kliënte wie se DNS met volgende-generasie volgordebepaling (NGS) ontleed is, het egter die opsie om 'n VCF-lêer af te laai. Om 'n VCF-lêer af te laai, moet jy die DNS-eienaar wees, DNS laat toets met NGS-tegnologie en ten minste 350 MB spasie op jou toestel beskikbaar hê.
